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簡要描述：蛋白質組學（Proteomics）是一種全面分析樣品中蛋白質的方法。它的過程包括從樣品中提取蛋白質、使用消化酶切割蛋白質，再通過液相色譜串聯質譜法（LC-MS/MS）分析肽段的結構信息。近數十年，大量的改進方法應用于LC-MS/MS，例如色譜柱和色譜填料的改進，以及質譜的靈敏度和掃描速度的提升，使得同時對多個樣本進行分析得以實現，與此同時，對于低豐度蛋白的定性以及定量評價也得以實現。
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蛋白質組學用蛋白質增溶劑
LysoPure™ Protein Extraction-PTS Solution
◆蛋白質組學中的蛋白提取挑戰
蛋白質組學（Proteomics）是一種全面分析樣品中蛋白質的方法。它的過程包括從樣品中提取蛋白質、使用消化酶切割蛋白質，再通過液相色譜串聯質譜法（LC-MS/MS）分析肽段的結構信息。近數十年，大量的改進方法應用于LC-MS/MS，例如色譜柱和色譜填料的改進，以及質譜的靈敏度和掃描速度的提升，使得同時對多個樣本進行分析得以實現，與此同時，對于低豐度蛋白的定性以及定量評價也得以實現。
LC-MS/MS的前處理步驟——蛋白質提取和酶切對蛋白質組學實驗結果起到至關重要的作用。其中最大的挑戰是提高蛋白質的回收率同時還需要在低漏切的情況下保證酶解效率。尤其是膜蛋白這類疏水性高難以提取的一類蛋白質。在蛋白質組學中膜蛋白的提取常需要使用強力的增溶劑。然而，強力的增溶劑會抑制后續步驟使用的消化酶的活性，影響肽段分離和LC-MS/MS中的離子的檢測。
因此，FUFJIFILM Wako開發了以脫氧膽酸鈉為主要成分的相轉移溶劑（Phase Transfer Surfactant），這是一款可溶解難溶蛋白，不抑制消化酶的活性且容易去除的理想增溶劑1）。使用了它的前處理法命名為PTS法，該方法已被廣泛報道為一種用于蛋白組學分析制備疏水蛋白（包括膜蛋白）的有效方法。
圖1. 使用PTS法提取蛋白
基于文獻1）制備
◆LysoPure™ Protein Extraction-PTS Solution
LysoPure™ Protein Extraction-PTS Solution是在蛋白質組學前處理步驟的蛋白提取中使用的增溶劑。該產品基于PTS方法開發，可有效溶解難溶性蛋白，同時不抑制消化酶的活性，并可通過液-液分配方式輕松去除試劑。本產品是根據之前的報道PTS溶液1-2）改良的，相比以前的PTS溶液，它的蛋白增溶性和蛋白消化酶活性更高，而且因消化酶導致的漏切也更低。也可用于外泌體等細胞外囊泡的蛋白質組學。
◆特點
● 可提取疏水性高的蛋白質，包括膜蛋白
● 不抑制消化酶活性
● 通過液液分配方式可輕易去除
◆Protocol
從細胞中提取蛋白
從細胞外囊泡（EV）中提取蛋白（使用MagCapture™ Exosome Isolation Kit PS Ver.2）
詳細的Protocol請參考產品的使用說明書。
◆數據
蛋白的可溶性
| 使用不同的表面活性劑混合組成的各種PTS溶液，從人肝微粒體組分中提取蛋白，比較各實驗組的蛋白濃度。 【結果】 與其他表面活性劑成分的傳統PTS溶液相比，本產品顯示高可溶性 |
蛋白消化酶的活性和漏切的發生率
蛋白消化酶的活性
PTS溶液 | yi蛋白酶 | 賴氨酰內肽酶（Lys-C） | ||||
PTS溶液的濃度 | 活性 | 初速度 | PTS溶液的濃度 | 活性 | 初速度 | |
SDC+SLS | 4 mM | 12.6 | 4.4 | 4 mM | 2.5 | 1.9 |
SDC+SC | 8 mM | 5.7 | 2.3 | 8 mM | 2.6 | 2.4 |
SDC+CDC | 8 mM | 7.5 | 4.4 | 8 mM | 2.4 | 1.8 |
本產品 | 8 mM | 10.3 | 4.6 | 8 mM | 2.6 | 1.8 |
漏切的發生數
PTS溶液 | 漏切發生數 |
UDC | 586 |
SDC+SLS | 723 |
SLS+SC | 273 |
本產品 | 291 |
CDC：e去氧膽酸；SC：膽酸鈉；SDC：脫氧膽酸鈉；SLS：月桂酰肌氨酸鈉；UDC：xiong去氧膽酸
【結果】
盡管SDS+SLS的yi蛋白酶活性最高，但漏切的數量最多。相比之下，盡管本產品在yi蛋白酶中的酶活性低于SDC+SLS，但賴胺酰內肽酶的裂解活性最高，漏切數較低。因此，本產品是一款酶活性高，漏切數少，性能平均的PTS溶液。
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| 產品編號 | 產品名稱 | 產品規格 | 產品等級 | 備注 |
| 127-07101 | LysoPure™ Protein Extraction-PTS Solution LysoPure™ 蛋白提取PTS溶液 | 5 mL | 基因研究用 | - |
| 產品編號 | 產品名稱 | 產品規格 | 產品等級 | 備注 |
| 038-21141 | Cell Lysis Buffer M 細胞溶解緩沖液M | 100 mL | 基因研究用 | - |
| 034-21143 | Cell Lysis Buffer M 細胞溶解緩沖液M | 250 mL | 基因研究用 | - |
| 182-02451 | RIPA Buffer | 100 mL | 基因研究用 | - |
| 188-02453 | RIPA緩沖液 | 250 mL | 基因研究用 | - |
| 295-73901 | LysoPure™ Nuclear and Cytoplasmic Extractor Kit 核和細胞蛋白提取試劑盒 | 100次用 | 蛋白質組學研究用 | - |
| 產品編號 | 產品名稱 | 產品規格 | 產品等級 | 備注 |
| 125-05061 | Lysyl EndopeptidaseR, Mass Spectrometry Grade (Lys-C) 賴氨酰肽鏈內切酶，MS級 | 20 μg×5 | 蛋白質組學研究用 | - |
| 121-05063 | Lysyl EndopeptidaseR, Mass Spectrometry Grade (Lys-C) 賴氨酰肽鏈內切酶，MS級 | 20 μg | 蛋白質組學研究用 | - |
| 202-15951 | Trypsin, from Porcine Pancreas, Mass Spectrometry Grade 質譜級豬胰腺來源yi蛋白酶 | 20 μg×5 | 蛋白質組學研究用 | - |
| 產品編號 | 產品名稱 | 產品規格 | 產品等級 | 備注 |
| 294-84101 | MagCapture™ Exosome Isolation Kit PS Ver.2 MagCapture™ 外泌體提取試劑盒PS Ver.2 | 2次用 | 基因研究用 | - |
| 290-84103 | MagCapture™ Exosome Isolation Kit PS Ver.2 MagCapture™ 外泌體提取試劑盒PS Ver.2 | 10次用 | 基因研究用 | - |
| 293-96401 | MagCapture™ EV Isolation Kit PS for HTS HTS用MagCapture™ 外泌體提取試劑盒PS | 96次用 | 蛋白質組學研究用 | - |
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